甘肃西峰黄土中细菌16S rDNA 文库的构建与组成初步分析

J4 ›› 2012, Vol. 18 ›› Issue (4): 765-.

甘肃西峰黄土中细菌16S rDNA 文库的构建与组成初步分析

黄晟，陈旸，潘雪莲，崔益斌，季峻峰，陈骏

出版日期:2012-12-20 发布日期:2012-12-28

Construction and Preliminary Analysis of the 16S rDNA Clone Library of Bacteria in the Xifeng Loess Section, the Northwest
　of China

HUANG Sheng， CHEN Yang， PAN Xuelian， CUI Yibin， JI Junfeng， CHEN Jun

Online:2012-12-20 Published:2012-12-28

摘要/Abstract

摘要：

对黄土高原西峰地区黄土沉积物中的有机质进行了总DNA 提取和PCR（聚合酶链式反应）扩增，通过克隆测序技
术构建了含有44 个克隆子的细菌16S rDNA 文库。对16S rDNA 系统发育的分析表明，西峰地区的黄土沉积物中细菌可分属
13 个类群，包括：酸杆菌（Acidobacteria）、变形菌（Proteobacteria）、放线菌（Actinobacteria）、绿弯菌（Chloroflexi）、厚壁菌（Firmicutes）、疣微菌（Verrucomicrobia）、浮霉菌（Planctomycetes）、芽单胞菌（Gemmatimonadetes）、异常球菌—栖热菌（Deinococcus-Thermus）、硝化螺旋菌（Nitrospirae）、蓝细菌（Cyanobacteria）、拟杆菌（Bacteroidetes）和Candidate divisionTG1。其中酸杆菌为最主要优势类群，变形菌为次优势类群，二者占黄土细菌总克隆数的70%，且大多为不可培养的基因型。

黄晟，陈旸，潘雪莲，崔益斌，季峻峰，陈骏. 甘肃西峰黄土中细菌16S rDNA 文库的构建与组成初步分析[J]. J4, 2012, 18(4): 765-.

HUANG Sheng， CHEN Yang， PAN Xuelian， CUI Yibin， JI Junfeng， CHEN Jun. Construction and Preliminary Analysis of the 16S rDNA Clone Library of Bacteria in the Xifeng Loess Section, the Northwest
　of China[J]. J4, 2012, 18(4): 765-.